В аптечных условиях растворы для наружного и внутреннего применения процеживают («пропускают») сквозь вату, растворы для инъекций и глазные капли (где требуется достижение очень высокой чистоты раствора) фильтруют сквозь бумажный фильтр с подложенным под него ватным тампоном.

Процеживание сквозь вату дает не всегда одинаковые результаты. Чистота раствора будет тем больше, чем плотнее свернут тампон ваты и чем туже он вложен в воронку. Однако при очень плотном слое ваты процеживание сильно замедляется. Воронки подбирают с расчетом, чтобы они вмещали сразу 25—30% жидкости, подлежащей процеживанию или фильтрации.

При фильтрации применяют два вида бумажных фильтров: складчатые, или плоеные, и гладкие. В аптечной практике применяют большей частью складчатый фильтр. Этот фильтр благодаря большому количеству складок имеет большую фильтрующую поверхность, не прилегает плотно к стенкам воронки, а поэтому и фильтрация протекает быстрее. Изготовляют его из квадратного куска фильтровальной бумаги, который складывают сначала пополам, а затем несколько раз по диагонали. Узкий конец фильтра не следует делать острым, так как это может привести к разрыву бумаги. Для устранения переливания жидкости через край воронки высота фильтра должна быть ниже высоты воронки на 0,5—1 см. Для предохранения фильтра от разрыва рекомендуется подкладывать небольшой неплотно свернутый тампон ваты и жидкость наливать понемногу по стенке фильтра. Воронка помещается в склянку таким образом, чтобы ее конец находился несколько ниже внутреннего края горлышка склянки.

Воронку над склянкой закрепляют с помощью штатива. При процеживании или фильтрации без штатива, если узкая часть воронки очень плотно прилегает к горлышку склянки, между воронкой и горлышком склянки помещают свернутую в несколько слоев полоску бумаги, которую сгибают под углом, чтобы она при снимании воронки не упала в жидкость. Нижний конец трубки должен находиться ниже горлышка склянки.

Для предохранения жидкости от загрязнения воронку следует накрывать чистой пластинкой из пластмассы или стекла. Чтобы волокна ваты или бумаги не попали в готовый раствор, сначала процеживают или фильтруют только часть жидкости, собирая фильтрат в отдельный сосуд и затем возвращая его вновь на фильтр. Происходящая при этом некоторая потеря жидкости (на пропитывание бумаги и ваты) при значительном количестве процеживаемой или фильтруемой жидкости не имеет существенного значения.

Чистоту жидкости проверяют путем легкого встряхивания и перевертывания укупоренной склянки с жидкостью и последующего ее наблюдения в прямом и отраженном свете. Если в жидкости содержатся взвешенные частицы, то они при этом опускаются вниз и попадают в поле зрения.